虽然黄花梨这个名称一直被人们使用着，但不得不说，它只是一个不规范的名称。因为从植物学上去探究，它并不是这个学名，而只是一个“俗称”，属于约定俗成的一种。
众所周知，我国出产黄花梨木的地方叫黎山，而当地的居民称为黎族人，因此，可能有些朋友会这样认为，黄花梨应该叫“黄花黎”，并通过植物学和地理学去举证，希望能将黄花梨从为数众多的花梨木中分离出去，避免大家将其与花梨木混为一谈。
史料记载，黄花梨曾有过多种名称，如：降压木、花狸、花榈、降香、花黎、香红、香枝、海南檀等，并有很长一段时间与“花梨”相混称。
依据当代国标红木分类，花梨木类为紫檀属，而黄花梨，亦就是降香黄檀则为黄檀属，两者之间可谓泾渭分明、互不相干。但由于二者外貌很相似、造成容易混淆的局面，前人为了将两者区分开来，不得已而为之，只能将花梨木称为新花梨，将黄花梨称为老花梨。
在年以前，人们通常将海南黄檀统称为黄花梨。而其中的海南黄檀又分为两种：一种心材较大，几乎占整个树径的五分之四，且多呈深褐色，边材多为黄褐色；另一种心材占其树径的比例较小，且多呈红褐至紫褐色，边材多为浅黄色。海南当地人把前者称为“花梨公”，把后者称为“花梨母”。直至年，专家对海南黄檀进行了重新定义，“花梨公”依旧称谓海南黄檀，而“花梨母”则称谓降香黄檀。
时至年5月，《红木国家标准》颁布实施，降香黄檀被归为黄檀属香枝木类，从那时起，黄花梨又多了一个别称——香枝木。
一直以来，对于黄花梨一词源于何时，众说纷纭，莫衷一是。较流行的说法有两种：一种可追溯至20世纪30年代，当时由著名学者梁思成等组建的中国营造学社在研究明、清家具时，为了将新、老花梨区别开来，便将老花梨冠之以“黄花梨”的称谓；另一种可追溯至民国时期，由于当时有大量的低档花梨进入市场，并被普遍使用，人们为了便于区别，才在老花梨之前加了“黄”字，从而使老花梨有了一个固定的名称——黄花梨。
据史料求证，如唐代陈藏器的《本草拾遗》、李恂的《海药本草》，明代王佐的《新增格古要论》，清代谷应泰的《博物要览》等著作里，都不曾有“黄花梨”一词出现。而在这些著作中，花梨与黄花梨是没有做区分的。提到花梨，也只是笼统地说其出自南番、安南及海南。
直至清朝光绪年间，有史料记载，《大清德宗皇帝实录》：“（光绪二十四年九月）庆亲王奕劻等奏，吉地宝龛木植漆色，请旨，遵行得旨，着改用黄花梨木，本色罩漆。”
庆亲王奕劻上折的时间是光绪二十三年，也就是公元年，综上所述，这可能就是关于“黄花梨木”在历史文献中出现得最早、最明确的记载了。